• Le Conseil d’Administration

• Le Conseil Scientifique d’Orientation

• La Direction

• Les Services et Départements Techniques

• Quatre Antennes régionales (situées à Fianarantsoa, Toamasina, Mahajanga, Toliary).

• Une Cellule Technologie de l’Information et de Communication

Et depuis Mai 2012, le CIDST héberge et gère le CATI (Centre d’Appui à la Technologie de l’Innovation)